Undercover Missions: Operation Kursk K-141 raconte une histoire de mystère et de trahison, inspirée par le véritable naufrage d’un sous-marin russe qui eut lieu en l'an 2000. Les joueurs prennent le contrôle de l'agent Belyaeva, alors qu'elle enquête sur une organisation criminelle soupçonnée de voler des armements russes. Lorsque votre camarade infiltré dans les rangs de l'organisation disparaît, c'est à vous qu'il revient de démasquer le cerveau de l'organisation avant que les 130 membres d'équipage ne finissent au fond de l'océan.